きちんと検証していませんが、
どうもLOGARCHMETH2 の設定をすると、即時反映されるようで
db2 update db cfg for DB名 using LOGARCHMETH2 DISK:/db2/db2inst1/ARCHIVELOG/DBname/NODE0000/
と打ったとたん、
設定ディレクトリにはアーカイブログファイルが数個作られていました。
運用を開始した後に設定追加でもたぶんよさそうですね。
(1つ目(LOGARCHMETH1)をoffからディレクトリを設定したら
オフラインバックアップは必要ですけどね。。。)